Programme des cours 2024-2025
BIMV2041-1  
Informatique appliquée à l'imagerie médicale
  • Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python)
  • Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2
Durée :
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python) : 22h Th
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2 : 16h Th
Nombre de crédits :
Bachelier : technologue en imagerie médicale3
Nom du professeur :
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python) : Geoffrey STENUIT
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2 : Olivier CHOQUET, David DELORY, Ayhan FINDIK
Coordinateur(s) :
Geoffrey STENUIT
Langue(s) de l'unité d'enseignement :
Langue française
Organisation et évaluation :
Enseignement au deuxième quadrimestre
Unités d'enseignement prérequises et corequises :
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement :
Le langage de programmation (Python) et l'informatique dans le milieu hospitalier (Réseaux, sécurité, DICOM, PACS, ...).



Compétences PIX vues

Pour BIMV2041 A - Python :

1. Informations et données - 1.3. Traiter des données

Culture des données (data) - Visualisation de données : Lire et interpréter des données avec un outil de visualisation et paramétrer leur affichage

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3. Création de contenu - 3.2. Développer des documents multimédias

Créer une image (matricielle) - Propriétés d'une image matricielle : Connaître les propriétés des images matricielles (définition, résolution, profondeur de couleurs...)

3. Création de contenu - 3.4. Programmer

Intelligence artificielle - Généralités sur l'intelligence artificielle : Connaître des généralités sur l'intelligence artificielle et l'apprentissage automatique

3. Création de contenu - 3.4. Programmer

Programme - Programme : Exécuter, corriger et compléter un programme informatique

3. Création de contenu - 3.4. Programmer

Algorithme - Exécution d'algorithme : Interpréter et appliquer un algorithme

3. Création de contenu - 3.4. Programmer

Algorithme - Ecriture d'algorithme : Analyser une suite d'actions et écrire l'algorithme correspondant (séquence, boucle, variable, ...)

 

Pour BIMV2041 B - Réseau et Dicom :

2. Communication et collaboration - 2.1. Interagir

Type de communication - Accès à une messagerie électronique : Connaître les éléments nécessaires à l'utilisation d'une messagerie électronique (adresse, fournisseur de service de messagerie, application)

2. Communication et collaboration - 2.1. Interagir

Configurer et paramétrer une messagerie électronique - Parcours d'un message (SMS, courriel) : Connaître les principes d'acheminement et de localisation des messages (SMS, courriels)

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4. Protection et sécurité - 4.1. Sécuriser l'environnement numérique

Comportement de prudence - Mot de passe robuste : Connaître les recommandations pour le choix d'un mot de passe robuste

4. Protection et sécurité - 4.1. Sécuriser l'environnement numérique

Comportement de prudence - Sécurité des mots de passe : Connaître les bonnes pratiques liées à la sécurisation des mots de passe face aux risques de dévoilement

4. Protection et sécurité - 4.1. Sécuriser l'environnement numérique

Comportement de prudence - Sources d'infection d'un ordinateur : Connaître les pratiques susceptibles d'infecter un ordinateur

4. Protection et sécurité - 4.1. Sécuriser l'environnement numérique

Sécurité des équipements - Antivirus : Connaître le rôle d'un antivirus et les bases de son utilisation

4. Protection et sécurité - 4.1. Sécuriser l'environnement numérique

Sécurité des équipements - Logiciels de protection : Connaître les logiciels de protection des équipements informatiques

4. Protection et sécurité - 4.1. Sécuriser l'environnement numérique

Sécurité d'un site web - HTTPS   : Identifier une connexion web sécurisée et connaître le principe de fonctionnement du protocole HTTPS

4. Protection et sécurité - 4.1. Sécuriser l'environnement numérique

Authentification sécurisée - Chiffrement des communications : Connaître les apports et le fonctionnement du chiffrement des communications

4. Protection et sécurité - 4.1. Sécuriser l'environnement numérique

Collecte des données personnelles et le droit - RGPD : Connaitre les principes clé de la législation européenne en matière de protection de données personnelles (objectif, droits, limites)

4. Protection et sécurité - 4.1. Sécuriser l'environnement numérique

Traces numériques - Adresse IP : Connaître l'adresse IP comme trace de connexion identifiante

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5. Environnement numérique - 5.2. Construire un environnement numérique

Réseau - Fonctionnement d'Internet : Connaître le principe de l'accès à Internet et les bases du protocole IP

5. Environnement numérique - 5.2. Construire un environnement numérique

Réseau - Le Web et le protocole http : Connaître le modèle client-serveur et les principes du protocole HTTP
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python)
 
Introduction
  • Programmation ?
  • Quelques définitions
  • Pourquoi le Python ?
  • Où trouve-t-on du Python ?
Premiers pas avec Python
  • Interpréteur Python, Programmes
  • Variables
  • Fonctions
  • Structures conditionnelles
  • Boucles
  • Listes, tuples
Fonctions et modularité
  • Def
  • math
  • matplotlib.pyplot
  • numpy
Image Processing in OpenCV
  • seuillage
  • autres traitements 
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2
Sensibiliser les étudiants à toute l'informatique utilisée en milieu hospitalier   Les réseaux - O.Choquet :


  • Définitions
  • Couche des applications (mail, http, ...)
  • Notions de sécurité (intégrité des données, confidentialité, cryptographie, ...)
  Le dossier patient informatisé (DPI) - A Findik   Les flux de données globaux au sein de l'hôpital    Pacs, DICOMS et liens avec le réseau hospitalier et le réseau de la radiologie - D. Delory
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement :
Acquis spécifiques visés :

  • Connaître un langage de programmation (Python)
  • Optimiser et automatiser l'utilisation des systèmes informatiques.
  • Connaître l'informatique réseau et la sécurité informatique utilisée en milieu hospitalier.
  • Utiliser efficacement et de manière sécurisée toutes les ressources informatiques disponibles en milieu hospitalier.
Compétence(s) - Capacité(s):
C1 - S'impliquer dans sa formation et dans la construction de son identité professionnelle
CA1.3 -Développer ses aptitudes d'analyse, de curiosité intellectuelle et de responsabilité
CA1.6 -Exercer son raisonnement scientifique
C5 - Assurer une communication professionnelle
CA5.2 -Utiliser les outils de communication existants
CA5.4 -Développer des modes de communication adaptés au contexte rencontré
Savoirs et compétences prérequis :
/  
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
BIMV2041 A : Exposé magistral et exercices résolus aux cours, en anglais/français.
 
BIMV2041 B : Exposés magistraux
 

Situation d'intégration:

Utiliser le langage de programmation Python et ses modules adéquats pour manipuler ou extraire des informations sur une image imposée. 

Introduire les concepts de base sur l'Intelligence Artificielle (IA) et mise en situation pratique (par exemple, détection d'objets dans une image) en codant en Python.
 
Les activités d'apprentissage BIMV2041 A et BIMV2041 B sont évaluées distinctement.

Le thème central de l'UE est l'informatique dans le secteur hospitalier. Chaque enseignant d'une activité d'apprentissage est un informaticien ou un scientifique spécialisé dans un domaine particulier de l'informatique. L'intégration des différentes notions vues dans cette UE se fera quand les étudiants seront en stage ou lors de la réalisation de leur TFE. 
Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride) :
Présentiel
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2
Exposés magistraux.
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python)
Support(s):
  • Diapositives disponibles sur Moodle
  Référence(s):
     
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2
Support(s):
  • Notes de cours et transparents
Référence(s):
  • O. Hélénon, J. Chabriais, B. Gibaud et D. Mariano-Goulart, Traitement de l'image de la numérisation à l'archivage et la communication, Elsevier Masson, 2013 ( ISBN:9782294736858).
Modalités d'évaluation et critères :
Responsable de l'évaluation: STENUIT Geoffrey
 

Langue de l'évaluation: Français

[Extrait du RGE]
L'étudiant qui ne participe pas assidûment aux activités d'enseignement peut se voir refuser la participation aux épreuves. 

 
Mode d'évaluation:

  • BIMV2041 A Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python) : Examen écrit et/ou oral sur PC
  • BIMV2041 B Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2 : Examen écrit et/ou oral
Pondération des évaluations:

En juin et septembre, la note de l'UE est calculée en appliquant une moyenne géométrique pondérée avec les pondérations suivantes  : 

BIMV2041 A = 50%
BIMV2041 B = 50%
                      

L'échec de l'UE oblige à représenter l'(les) activité(s) en échec.

Cette UE est composée d'activités d'apprentissage distinctes donnant lieu, à partir de 10/20, à des reports de notes d'une session à l'autre et d'une année académique à l'autre.
 
Les étudiants qui ne savent absolument pas participer à l'évaluation continue car il y a un conflit entre deux activités avec évaluation continue sont priés de contacter le responsable d'UE.
 
Stage(s) :
Remarques organisationnelles :
 / 
Contacts :