Programme des cours 2024-2025
BCHV2130-1  
Traitement informatique des données de laboratoire, Traitement informatique des données de laboratoire
Durée :
20h Th
Nombre de crédits :
Bachelier en chimie, orientation chimie appliquée2
Nom du professeur :
Bernard FRANK, Majda TALAMAKROUNI
Coordinateur(s) :
Majda TALAMAKROUNI
Langue(s) de l'unité d'enseignement :
Langue française
Organisation et évaluation :
Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier
Unités d'enseignement prérequises et corequises :
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement :
Faisant suite à l'unité d'enseignement (UE) d'Introduction à la Statistique du bloc1, cette UE-ci va permettre aux étudiants de maitriser une série d'outils et procédures statistiques spécifiques à l'analyse des données récoltées en laboratoire.  Cela inclut le choix d'un outil approprié, sa mise en oeuvre à l'aide d'un logiciel statistique dédié, l'interprétation des résultats et leur présentation sous forme de rapport.
Cette UE est formée d'une unique activité d'apprentissage, proposant tant des exposés théoriques des matières abordées que des illustrations pratiques et leurs mises en oeuvre.
Elle aborde les sujets suivants :
  • Une démarche générale de traitement d'un problème scientifique faisant intervenir la statistique inférentielle ;
  • La structuration d'un rapport scientifique, ainsi que quelques règles de rédaction d'un tel rapport ;
  • L'introduction à un logiciel spécifiquement dédié à l'analyse statistique, à savoir le logiciel R ;
  • La détection de données suspectes et leur traitement ;
  • Le diagnostic de l'appartenance à une distribution normale d'un échantillon d'observations ;
  • Les notions d'estimation ponctuelle, d'estimation par intervalle de confiance et de tests d'hypothèses paramétriques et non paramétriques ;
  • Les tests d'hypothèses les plus courants concernant la tendance centrale et la dispersion d'une ou deux populations normales. Les tests non paramétriques de base correspondants concernant la tendance centrale ;
  • La régression linéaire simple univariée ;
  • Le test principal du modèle ANOVA à un facteur fixe et son pendant non paramétrique ;
  • La construction et l'utilisation de cartes de contrôle ;
  • Les tests d'adéquations appelés tests chi-carrés.
Pour chaque thème abordé, les principes théoriques sont exposés, puis une mise en situation dans un contexte concret est proposée, avec utilisation des logiciels Excel et R.  Lors des mises en situation, une importance particulière est apportée à l'interprétation des résultats obtenus via le logiciel utilisé et au rapport à un tiers de ces résultats dans leur contexte.  
 
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement :
Acquis d'apprentissage(s) spécifique(s) visé(s):

  • D'expliquer comment planifier, mener à bien et rapporter une étude statistique, en suivant des règles de bonne pratique scientifique ;
  • De rapporter les résultats d'une étude statistique en suivant des règles de bonne pratique scientifique ;
  • D'utiliser un logiciel statistique pour effectuer des analyses de base et d'interpréter les résultats fournis par ce logiciel ;
  • De déterminer, face à un contexte inédit, le ou les outils statistiques les plus appropriés pour répondre à une question spécifique, parmi les outils vus au cours ;
  • De vérifier le caractère raisonnable des hypothèses à respecter pour utiliser les outils statistiques vus au cours ;
  • D'expliquer les concepts et principes sous-jacents aux outils statistiques vus au cours.
Compétence(s) - Capacité(s):

1- S'impliquer dans sa formation et dans la construction de son identité professionnelle.

2- Prendre en compte les dimensions déontologiques, éthiques, légales et réglementaires.

3 - Gérer (ou participer à la gestion) les ressources humaines, matérielles et administratives.

4 - Concevoir des projets techniques ou professionnels complexes dans les domaines biomédical et pharmaceutique.

5 - Assurer une communication professionnelle.

6 - Pratiquer les activités spécifiques au domaine des sciences biomédicales : Valider les analyses en s'assurant de leur cohérence et de leur signification clinique.

Acquis d'apprentissage(s) terminaux visé(s):

  • Aat 03 - Analyser les méthodes de laboratoire, leur mise en pratique et la pertinence du résultat en mobilisant les concepts scientifiques acquis.
  • Aat 04 - Traiter les données expérimentales d'un point vue mathématique, graphique ou statistique, en utilisant les outils informatiques, afin de produire les résultats d'une analyse chimique.
  • Aat 08 - Communiquer les données scientifiques théoriques et expérimentales en lien avec les activités dont il est responsable, aussi bien oralement que par écrit, avec les collègues et la hiérarchie.
 
Savoirs et compétences prérequis :
BCHV1110 - Introduction à la Statistique
 
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
L'UE est composée d'une activité d'apprentissage unique de 20h : BCHV2130-A Traitment Informatique des Données de Laboratoire.
Chaque cours dure 2h.  Ces cours incluent les exposés théoriques ainsi que des exercices pratiques, incluant l'utilisation de logiciels permettant de mettre en oeuvre les analyses statistiques qu'ils illustrent.
 
Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride) :
Les cours ont lieu en présentiel.  Une majorité d'entre eux a lieu dans une salle mettant des PC à disposition des étudiants.

À la fin de chaque cours, un travail de préparation au cours suivant est spécifié aux étudiants.

Les exercices pratiques permettent de travailler, entre autres, les savoirs et savoir-faire suivants :
- Faire des calculs dans une feuille de calcul ;
- Savoir comment une formule s'adapte lorsqu'elle est copiée dans une autre cellule ;
- Réaliser un graphique dans une feuille de calcul ;
- Trier des données dans une feuille de calcul
- Mettre en forme les éléments d'un classeur (cellule, colonne, ligne) ;
- Distinguer la valeur et l'affichage des cellules dans un classeur ;
- Saisir, intégrer et manipuler des données dans un classeur ;
- Importer un fichier de données externe dans un logiciel de traitement de données ;
- Exécuter des instructions en mode "ligne de commande" ;
- Interpréter des outputs produits par un logiciel statistique professionnel.
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
Tous les documents mis à dispostion des étudiants dans le cadre du cours sont disponibles sur la plate-forme Moodle de la HE Vinci.
Un livre (non indispensable) pratique sur l'utilisation de R, très bien fait, avec des rappels théoriques et le détail des instructions en R pour obtenir les résultats proposés, est disponible à la bibliothèque : "Statistiques avec R -- P.-A. Cornillon et al -- Presses Universitaires de Rennes -- 2008"
 
Modalités d'évaluation et critères :
L'évaluation est constituée d'un examen sur ordinateur avec réponses sur questionnaire papier, intervenant pour 100% de la note de l'UE.  C'est un examen écrit individuel, pouvant inclure tant des questions ouvertes que des questions à choix multiples à réponse unique ou réponses multiples.  Une synthèse du cours, fournie par l'enseignant, est autorisée durant la partie pratique de l'examen ; aucune autre documentation n'y est autorisée.

Les modalités de l'examen sont indentiques en première et en seconde session.

 
Stage(s) :
Remarques organisationnelles :
Contacts :
Monsieur Bernard FRANK - bernard.frank@vinci.be