Programme des cours 2022-2023
BIMV2041-1  
Informatique appliquée à l'imagerie médicale
  • Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python)
  • Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2
Durée :
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python) : 20h Th
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2 : 18h Th
Nombre de crédits :
Bachelier : technologue en imagerie médicale3
Nom du professeur :
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python) : Geoffrey STENUIT
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2 : Olivier CHOQUET, David DELORY, Ayhan FINDIK
Coordinateur(s) :
Geoffrey STENUIT
Langue(s) de l'unité d'enseignement :
Langue française
Organisation et évaluation :
Enseignement au deuxième quadrimestre
Unités d'enseignement prérequises et corequises :
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement :
Le langage de programmation (Python) et l'informatique dans le milieu hospitalier (Réseaux, sécurité, DICOM, PACS, ...).
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python)
 
Introduction
  • Programmation ?
  • Quelques définitions
  • Pourquoi le Python ?
  • Où trouve-t-on du Python ?
Premiers pas avec Python
  • Interpréteur Python, Programmes
  • Variables
  • Fonctions
  • Structures conditionnelles
  • Boucles
  • Listes, tuples
Fonctions et modularité
  • Def
  • math
  • matplotlib.pyplot
  • numpy
Image Processing in OpenCV
  • seuillage
  • autres traitements 
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2
Sensibiliser les étudiants à toute l'informatique utilisée en milieu hospitalier   Les réseaux - O.Choquet :


  • Définitions
  • Couche des applications (mail, http, ...)
  • Notions de sécurité (intégrité des données, confidentialité, cryptographie, ...)
  Le dossier patient informatisé (DPI) - A Findik   Les flux de données globaux au sein de l'hôpital    Pacs, DICOMS et liens avec le réseau hospitalier et le réseau de la radiologie - D. Delory
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement :
Acquis spécifiques visés :

  • Connaître un langage de programmation (Python)
  • Optimiser et automatiser l'utilisation des systèmes informatiques.
  • Connaître l'informatique réseau et la sécurité informatique utilisée en milieu hospitalier.
  • Utiliser efficacement et de manière sécurisée toutes les ressources informatiques disponibles en milieu hospitalier.
Compétence(s) - Capacité(s):
C1 - S'impliquer dans sa formation et dans la construction de son identité professionnelle
CA1.3 -Développer ses aptitudes d'analyse, de curiosité intellectuelle et de responsabilité
CA1.6 -Exercer son raisonnement scientifique
C5 - Assurer une communication professionnelle
CA5.2 -Utiliser les outils de communication existants
CA5.4 -Développer des modes de communication adaptés au contexte rencontré
Savoirs et compétences prérequis :
/  
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
BIMV2041 A : Exposé magistral et exercices résolus aux cours. Réalisation d'un travail individuel (écriture d'un script) à défendre pendant l'examen oral/écrit.
 
BIMV2041 B : Exposé magistraux
 

Situation d'intégration:

Ecrire un programme en python dont la fonctionnalité vise à optimiser et automatiser l'utilisation de son PC lors de l'exécution d'une tâche choisie par l'étudiant. 
 
Les activités d'apprentissage BIMV2041 A et BIMV2041 B sont évaluées distinctement.

Le thème central de l'UE est l'informatique dans le secteur hospitalier. Chaque enseignant d'une activité d'apprentissage est un informaticien ou un scientifique spécialisé dans un domaine particulier de l'informatique. L'intégration des différentes notions vues dans cette UE se fera quand les étudiants seront en stage ou lors de la réalisation de leur TFE. 
Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride) :
Présentiel
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2
Exposés magistraux.
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python)
Support(s):
  • Diapositives disponibles sur Moodle
  Référence(s):
     
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2
Support(s):
  • Notes de cours et transparents
Référence(s):
  • O. Hélénon, J. Chabriais, B. Gibaud et D. Mariano-Goulart, Traitement de l'image de la numérisation à l'archivage et la communication, Elsevier Masson, 2013 ( ISBN:9782294736858).
Modalités d'évaluation et critères :
Responsable de l'évaluation: STENUIT Geoffrey
 

Langue de l'évaluation: Français

[Extrait du RGE]
L'étudiant qui ne participe pas assidûment aux activités d'enseignement peut se voir refuser la participation aux épreuves. 

 
Mode d'évaluation:

  • BIMV2040 A Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python) : Examen écrit et/ou oral sur PC
  • BIMV2040 B Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2 : Examen écrit et/ou oral
Pondération des évaluations:

En juin et septembre, la note de l'UE est calculée en appliquant une moyenne géométrique pondérée avec les pondérations suivantes  : 

BIMV2040 A = 50%
BIMV2040 B = 50%
                      

L'échec de l'UE oblige à représenter l'(les) activité(s) en échec.

Cette UE est composée d'activités d'apprentissage distinctes donnant lieu, à partir de 10/20, à des reports de notes d'une session à l'autre et d'une année académique à l'autre.
 
Les étudiants qui ne savent absolument pas participer à l'évaluation continue car il y a un conflit entre deux activités avec évaluation continue sont priés de contacter le responsable d'UE.
 
Stage(s) :
Remarques organisationnelles :
Tenant compte de la situation sanitaire et du Protocole pour la reprise des cours dans l'enseignement supérieur émanant de la Ministre Glatigny, les modalités prévues pour l'organisation et l'évaluation de cette Unité d'enseignement sont susceptibles d'être modifiées en cas d'évolution du risque épidémique et d'un retour vers un confinement total ou partiel.
Contacts :