Programme des cours 2022-2023
BBMV2100-1  
Génétique humaine et microbienne
  • Génétique
  • Virologie
  • Travaux Pratiques de Génie génétique
Durée :
Génétique : 24h Th
Virologie : 12h Th
Travaux Pratiques de Génie génétique : 12h Pr
Nombre de crédits :
Bachelier : technologue de laboratoire médical4
Nom du professeur :
Génétique : Etienne NYSSEN
Virologie : Geraldine DESSILLY
Travaux Pratiques de Génie génétique : Caroline HUYGENS, Etienne NYSSEN
Coordinateur(s) :
Etienne NYSSEN
Langue(s) de l'unité d'enseignement :
Langue française
Organisation et évaluation :
Enseignement au deuxième quadrimestre
Unités d'enseignement prérequises et corequises :
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement :
La génétique moléculaire occupe une place croissante dans la recherche d'une meilleure compréhension du vivant. Elle s'impose comme outil diagnostic en pathologie microbienne et humaine. Elle permet des progrès dans le domaine de la prophylaxie et de la thérapeutique.   C'est pourquoi elle constitue un des fondements des disciplines biomédicales.
Génétique
Le cours poursuit deux objectifs. Le premier est d'apprendre la façon dont l'information génétique est stockée, transmise et exprimée dans les cellules procaryote et eucaryote. Il complète en cela la vision proposée par le cours de virologie.   Il vise également à faire découvrir les techniques d'étude et de manipulation des acides nucléiques au laboratoire et d'en définir les champs d'application.   Il souhaite ainsi faire apparaître le bénéfice que tirent la biologie médicale et la médecine humaine de ces connaissances et de ces outils.   Plan du cours L'enseignement des différentes parties du cours est coordonné avec le cours de virologie. Il inclut les chapitres suivants :   I Stockage de l'information 1.La base moléculaire : Les acides nucléiques 2.Organisation du stockage : Le chromosome 3.Organisation de l'information   II Pérennité et variation de l'information 1.La réplication de l'ADN 2.Réparation de l'ADN 3.Variations génétiques Mutations ponctuelles, Remaniements étendus : origines et conséquences.   III Expression régulée du message 1.Expression régulée des gènes procaryotes 2.Transcription et traduction de gènes eucaryotes et régulation.   IV Analyse moléculaire et manipulation d'un génome 1.Méthodes d'étude du génome 2.Méthodes de clonage 3.Méthodes d'analyse de l'expression et de mutagénèse
Virologie
Au terme de cette activité d'apprentissage, l'étudiant sera capable de :
  • Expliquer les caractères généraux des virus,
  • Nommer les différentes parties de la structure des virus,
  • Expliquer les différentes étapes générales du cycle viral,
  • Enumérer et expliquer les différents types de variation génétique des virus et donner un exemple de mutation ponctuelle, de recombinaison et de réassortiment,
  • Décrire les différents modes de transmission des virus,
  • Expliquer l'utilité des différents types de tests de laboratoire en virologie,
  • Comprendre les notions de qualité générale des tests (sensibilité, spécificité, etc.),
  • Enumérer les principales familles de virus ayant une implication en pathologie humaine, et comprendre les mécanismes pathogènes utilisés par certains virus au travers d'exemples choisis,
  • Expliquer les différences entre les différents types de vaccins antiviraux.
Les travaux proposés aux étudiants en marge du cours magistral ont pour but de :  
  • Développer ses capacités d'analyse technique d'une situation relative au contexte d'un laboratoire d'analyses biologiques,
  • Développer ses capacités de régulation et d'organisation de son travail,
  • Développer ses capacités de travail en équipe.
  Plan des notes de cours   Virologie générale Chapitre 1 : Généralités 1.1. Découverte des virus : bref historique 1.2. Caractères généraux des virus 1.3. Structure d'une particule virale 1.4. Classification des virus 1.5. Cycle viral 1.6. Modifications génétiques des virus   Chapitre 2 : Relations entre le virus et son hôte 2.1. Interaction virus - cellule 2.2. Evolution des infections virales 2.3. Mécanismes physiopathologiques 2.4. Spécificité d'organe   Chapitre 3 : Transmission et épidémiologie 3.1. Transmission des virus 3.2. Comportement du virus dans l'hôte 3.3. Comportement du virus dans la population   Chapitre 4 : Diagnostic des infections virales 4.1. Buts recherchés 4.2. Diagnostic direct et indirect 4.3. Caractéristiques d'un test     Principaux pathogènes humains Chapitre 5 : Virus Herpes Chapitre 6 : Hépatites virales Chapitre 7 : Virus respiratoires Chapitre 8 : Virus gastro-intestinaux Chapitre 9 : Virus du SIDA et autres virus transmis par voie sexuelle     Partie développée par les étudiants (travaux de groupes)
Travaux Pratiques de Génie génétique
Ces travaux pratiques permettent l'initiation à la manipulation des acides nucléiques au laboratoire. La mise en œuvre de quelques techniques associées au génie génétique ainsi que d'outils enzymatiques et informatiques couramment utilisés en génétique moléculaire renforce l'apprentissage des méthodes d'analyse et de manipulation des génomes évoquées aux cours théoriques de Génétique et de Virologie.
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement :
  • Discuter les défis éthiques liés à l'utilisation des outils de la génétique moléculaire dans l'analyse ou la manipulation des génomes.
  • Expliquer la base moléculaire de la transmission et de l'expression régulée du matériel génétique viral, procaryote et eucaryote.
  • Expliciter les bases structurelles et fonctionnelles de la classification virale et la diversité des espèces et des modes de transmission qui en découlent.
  • Décrire les origines moléculaires des mutations, leurs effets sur l'expression génétique, la diversité virale et la pathogénie microbienne et humaine.
  • Enoncer les principes, les conditions d'utilisation et les limitations des techniques clefs de la génomique, de la protéomique et de la sérologie utilisées dans les laboratoires de génétique microbienne et humaine.
  • Caractériser les méthodes de biologie moléculaire utilisées dans le développement d'outils prophylactiques ou thérapeutiques.
  • Maîtriser les principes de base de l'étude et de la manipulation des acides nucléiques au laboratoire.
  • Choisir en les justifiant, les méthodes de biologie moléculaire adaptées à l'analyse d'un génome et au diagnostic d'une variation génétique donnée.
  • Interpréter les données expérimentales acquises lors des manipulations de biologie moléculaire et cellulaire.
Compétence(s) - Capacité(s): C2 - Prendre en compte les dimensions déontologiques, éthiques, légales et réglementaires CA2.2 - Pratiquer à l'intérieur du cadre éthique C4 - Concevoir des projets techniques ou professionnels complexes dans les domaines biomédical et pharmaceutique CA4.1 - Intégrer les connaissances des sciences fondamentales, biomédicales et professionnelles CA4.3 - Utiliser des concepts, des méthodes, des protocoles CA4.4 - Evaluer la pertinence d'une analyse, d'une méthode   Acquis d'apprentissage(s) terminaux visé(s): - Acquis d'apprentissage terminaux : Aat 02 - intégrer les préoccupations éthiques, déontologiques et normatives afin d'adopter un comportement responsable, respectueux des réglementations en vigueur et de la dignité humaine. ( Aat 02) - Acquis d'apprentissage terminaux : Aat 04 - élaborer un projet expérimental, de sa conception à sa mise en œuvre, avec autonomie et rigueur, en intégrant les connaissances des sciences fondamentales, biomédicales et technologiques ainsi que l'ensemble des données contextuelles. ( Aat 04) - Acquis d'apprentissage terminaux : Aat 05 - analyser avec un sens critique, la validité des méthodes et la signification de résultats expérimentaux en mobilisant les outils statistiques, informatiques et les recommandations de l'assurance qualité. ( Aat 05)    
Savoirs et compétences prérequis :
Prérequis
  • BBMV1120-1
  • BBMV1140-1
Corequis
  • BBMV2040-1
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
Activités         Intitulé de l'activité                           Volume horaire BBMV2100-A-a    Génétique                                                      24 BBMV2100-B-a    Virologie                                                        12 BBMV2100-C-a    Travaux Pratiques de Génie génétique              12
Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride) :
Présentiel.
Génétique
Cours magistral.
Virologie
Plusieurs activités se déroulent en parallèle :



  • une partie magistrale exposée par le professeur en classe ;
  • un travail par groupe de 4 ou 5 étudiants : chaque groupe aura un sujet différent dont la production finale (Ecrit 3 pages) constituera une partie des notes de cours.
 
 
Travaux Pratiques de Génie génétique
Travaux pratiques.
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
Génétique
Support(s):
  • Syllabus mis à disposition reprenant les éléments projetés au cours.
Référence(s):
  • Introduction à l'analyse génétique - CARROLL Sean B, DOEBLEY John, GRIFFITHS Anthony J F, WESSLER Susan - Editeur : de boeck supérieur - 2013.
  • Génétique moléculaire humaine (4° Éd.) - STRACHAN Tom, READ Andrew - Editeur : Médecine Sciences Lavoisier - 2012.
  • Introduction aux biotechnologies en santé - BOURGOIN Sandrine - Editeur : LAVOISIER / TEC ET DOC - 2015.
Virologie
  • Notes de cours de virologie (syllabus)
  • Site web virologie-uclouvain.be
  • Diaporamas projetés au cours
Travaux Pratiques de Génie génétique
Notes de laboratoire.
Modalités d'évaluation et critères :
Responsable de l'évaluation: NYSSEN Etienne
 
Langue de l'évaluation: Français
 
Mode d'évaluation: Examen écrit, Evaluation continue, Travail de groupe





  • BBMV2100-A-a - Génétique : L'évaluation est réalisée en fin de formation, lors d'un examen écrit (70 % de la note, complétés par l'évaluation de BBMV2100-C-a).
  • BBMV2100-B-a - Virologie : Examen écrit en fin de formation et évaluation de travaux.
  • BBMV2100-C-a - Travaux pratiques de Génie génétique : évaluation incluse dans celle de BBMV2100 A (30 % de la note) sous forme d'évaluation continue et d'un examen écrit.
Pondération des évaluations:
Cette U.E. est composée d'activités d'apprentissage distinctes, BBMV2100-A-a/BBMV2100-C-a d'une part et BBMV2100-B-a d'autre part, donnant lieu, à partir de 10/20, à des reports de notes d'une session à l'autre et d'une année académique à l'autre.
 
Les activités d'apprentissage BBMV2100-A-a/BBMV2100-C-a contribuent à 70 % de la cote finale de l'UE, tandis que l'activité d'apprentissage BBMV2100-B-a conribue à 30 % de la note finale de l'UE.
 
 
BBMV2100-B-a - La partie de la cote accordée à l'évaluation des travaux obtenue lors de la session de juin fait l'objet d'un report lors de la session d'août.
 
BBMV2100-C-a - Travaux pratiques de Génie génétique : la partie de la cote accordée à l'
évaluation continue obtenue lors de la session de juin et incluse dans la cote de l'activité d'apprentissage BBMV2100-A-a, fait l'objet d'un report d'une session à l'autre et d'une année académique à l'autre. La note accordée à l'évaluation écrite n'est pas reportée d'une session à l'autre ou d'une année académique à l'autre.
 
                                          BBMV2100-A-a          BBMV2100-C-a
1ère session (juin)
- Evaluation continue                                                 19%
- Examen                                  70%                         11%

2ème session (septembre)

- Evaluation continue                                                 19%
- Examen                                  70%                         11%
Virologie
  • Examen écrit (questions ouvertes, QCM)
  • Travail de groupe
Stage(s) :
Remarques organisationnelles :
Tenant compte de la situation sanitaire et du Protocole pour la reprise des cours dans l'enseignement supérieur émanant de la Ministre Glatigny, les modalités prévues pour l'organisation et l'évaluation de l'Unité d'enseignement  BBMV 2100 sont susceptibles d'être modifiées en cas d'évolution du risque épidémique et d'un retour vers un confinement total ou partiel
Travaux Pratiques de Génie génétique
Pour des raisons d'hygiène et de sécurité, il est demandé aux étudiant.e.s de porter une tenue adéquate lors des activités de laboratoire. Celle-ci comprend notamment un tablier blanc fermé, propre et en bon état et des chaussures fermées. Les cheveux longs doivent être attachés. Le port du foulard est autorisé ; celui-ci doit être en coton blanc et rentré dans le tablier.
Contacts :
etienne.nyssen@vinci.be