Programme des cours 2021-2022
BIMV2040-1  
Informatique appliquée à l'imagerie médicale
  • Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python)
  • Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2
  • Recherche documentaire
Durée :
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python) : 20h Th
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2 : 18h Th
Recherche documentaire : 8h Pr
Nombre de crédits :
Bachelier : technologue en imagerie médicale4
Nom du professeur :
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python) : Geoffrey STENUIT
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2 : Olivier CHOQUET
Recherche documentaire : Letizia DE LUCA, Geoffrey STENUIT
Coordinateur(s) :
Geoffrey STENUIT
Langue(s) de l'unité d'enseignement :
Langue française
Organisation et évaluation :
Enseignement au deuxième quadrimestre
Unités d'enseignement prérequises et corequises :
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement :
Le langage de programmation (Python), l'informatique dans le milieu hospitalier (Réseaux, DICOM, PACS, ...) et la recherche documentaire sur internet.
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python)
 
Introduction
  • Programmation ?
  • Quelques définitions
  • Pourquoi le Python ?
  • Où trouve-t-on du Python ?
Premiers pas avec Python
  • Interpréteur Python, Programmes
  • Variables
  • Fonctions
  • Structures conditionnelles
  • Boucles
  • Listes, tuples
Fonctions et modularité
  • Def
  • math
  • matplotlib.pyplot
  • numpy
Image Processing in OpenCV
  • seuillage
  • autres traitements 
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2
Sensibiliser les étudiants à toute l'informatique utilisée en milieu hospitalier   Les réseaux - O.Choquet :


  • Définitions
  • Couche des applications (mail, http, ...)
  • Notions de sécurité (intégrité des données, confidentialité, cryptographie, ...)
  Le dossier patient informatisé (DPI) - A Findik   Les flux de données globaux au sein de l'hôpital    Pacs, DICOMS et liens avec le réseau hospitalier et le réseau de la radiologie - D. Delory
Recherche documentaire
Question documentaire - Préciser le sujet de la recherche. - Définir les mots-clés pertinents afin d'optimiser la recherche dans les bases de données.   Outils de recherche : - Maîtriser les différents types d'outils permettant une recherche efficace. - Choisir les outils en fonction de l'information recherchée et du niveau attendu de cette information (catalogue de bibliothèque, bases de données bibliographiques spécialisées, moteurs de recherche...).   Evaluation de l'information : - Déterminer la pertinence, la qualité et le niveau des informations.   Citation des sources et notion de plagiat : - Rédiger une bibliographie selon les normes reconnues. - Identifier et éviter le plagiat
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement :
Acquis spécifiques visés :
  • Connaître un langage de programmation (Python)
  • Optimiser et automatiser l'utilisation des systèmes informatiques.
  • Utiliser efficacement et de manière sécurisée toutes les ressources informatiques disponibles en milieu hospitalier.
  • Effectuer une recherche d'informations scientifiques sur internet et évaluer le résultat de sa recherche.
Compétence(s) - Capacité(s): C1 - S'impliquer dans sa formation et dans la construction de son identité professionnelle CA1.3 -Développer ses aptitudes d'analyse, de curiosité intellectuelle et de responsabilité CA1.6 -Exercer son raisonnement scientifique C5 - Assurer une communication professionnelle CA5.2 -Utiliser les outils de communication existants CA5.4 -Développer des modes de communication adaptés au contexte rencontré
Savoirs et compétences prérequis :
BIMV1040-1 - Initiation à l'informatique
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
BIMV2040 A : Exposé magistral et exercices résolus aux cours. Réalisation d'un travail individuel (écriture d'un script) à défendre pendant l'examen oral/écrit.   BIMV2040 B : Exposé magistraux   BIMV2040 C : Exposés magistraux directement suivis de mises en situation
 
Situation d'intégration:

Ecrire un programme en python dont la fonctionnalité vise à optimiser et automatiser l'utilisation de son PC lors de l'exécution d'une tâche choisie par l'étudiant.     
Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride) :
Présentiel
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2
Exposés magistraux.
Recherche documentaire
Exposés magistraux, exercices encadrés et corrigés.
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python)
Support(s):
  • Diapositives disponibles sur Moodle
  Référence(s):
     
Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2
Support(s):
  • Notes de cours et transparents
Référence(s):
  • O. Hélénon, J. Chabriais, B. Gibaud et D. Mariano-Goulart, Traitement de l'image de la numérisation à l'archivage et la communication, Elsevier Masson, 2013 ( ISBN:9782294736858).
Recherche documentaire
Notes de cours.
Modalités d'évaluation et critères :
Responsable de l'évaluation: STENUIT Geoffrey   Langue de l'évaluation: Français   Mode d'évaluation:
  • BIMV2040 A Informatique appliquée à l'imagerie médicale 1 (Python) : Examen écrit et/ou oral sur PC
  • BIMV2040 B Informatique appliquée à l'imagerie médicale 2 : Examen écrit et/ou oral (sur PC)
  • BIMV2040 C Recherche documentaire : Travail à réaliser
  Pondération des évaluations:
La note de l'UE est calculée en appliquant une moyenne géométrique pondérée avec les pondérations suivantes  : 
BIMV2040 A = 40% BIMV2040 B = 40% BIMV2040 C = 20%                             

L'échec de l'UE oblige à représenter l'(les) activité(s) en échec.
Cette UE est composée d'activités d'apprentissage distinctes donnant lieu, à partir de 10/20, à des reports de notes d'une session à l'autre et d'une année académique à l'autre.   Les étudiants qui ne savent absolument pas participer à l'évaluation continue car il y a un conflit entre deux activités avec évaluation continue sont priés de contacter le responsable d'UE.  
Stage(s) :
Remarques organisationnelles :
Tenant compte de la situation sanitaire et du Protocole pour la reprise des cours dans l'enseignement supérieur émanant de la Ministre Glatigny, les modalités prévues pour l'organisation et l'évaluation de cette Unité d'enseignement sont susceptibles d'être modifiées en cas d'évolution du risque épidémique et d'un retour vers un confinement total ou partiel.
Contacts :
Recherche documentaire
Expert invité : Letizia De Luca